Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROM2Q8N271 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms