Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms