Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP53Q70EK8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP53Q70EK8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms