Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms