Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TSSK4Q6SA08 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms