Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
SPATA8Q6RVD6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms