Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTR9Q6PD62 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTR9Q6PD62 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTR9Q6PD62 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTR9Q6PD62 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTR9Q6PD62 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms