Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFCAB12Q6NXP0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms