Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM29Q5VYK3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECM29Q5VYK3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms