Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM208BQ5VWN6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms