Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYOM3Q5VTT5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYOM3Q5VTT5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms