Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PRPF38BQ5VTL8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRPF38BQ5VTL8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRPF38BQ5VTL8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PRPF38BQ5VTL8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms