Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYT6Q5T7P8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms