Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C10orf55Q5SWW7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C10orf55Q5SWW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C10orf55Q5SWW7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C10orf55Q5SWW7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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