Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRRC23Q53EV4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms