Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
DUSP28Q4G0W2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DUSP28Q4G0W2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms