Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP27-1Q3LI81 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms