Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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RRN3P1Q2M238 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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RRN3P1Q2M238 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RRN3P1Q2M238 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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