Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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CTF1Q16619 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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CTF1Q16619 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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