Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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