Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PCSK7Q16549 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms