Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZFHX3Q15911 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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