Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
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NCOA1Q15788 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
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