Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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