Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB35Q15286 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB35Q15286 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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