Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms