Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSHL1Q14406 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSHL1Q14406 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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