Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms