Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms