Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FHL3Q13643 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms