Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTCH1Q13635 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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