Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2Q13563 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
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