Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BFSP2Q13515 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BFSP2Q13515 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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