Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PICALMQ13492 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PICALMQ13492 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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