Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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ITGB3BPQ13352 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
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