Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRSF5Q13243 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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