Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRDNQ13061 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms