Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK3Q13003 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK3Q13003 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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