Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BPTFQ12830 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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