Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXO1Q12778 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOXO1Q12778 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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