Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LRP1Q07954 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms