Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms