Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBXN1Q04323 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBXN1Q04323 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms