Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms