Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPCQ01831 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPCQ01831 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms