Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSG4Q00888 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms