Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLTCQ00610 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms