Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IP78347 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms