Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERV-K104P61576 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P61576 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms