Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMD4P55036 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms